Portal Box to gra logiczno-platformowa 3D, w której gracz steruje zielonym pudełkiem za pomocą klawiszy strzałek na klawiaturze. Gdy zielone pudełko zacznie się poruszać, nie zatrzyma się, dopóki nie dotrze do końca platformy lub bloku. Głównym celem zielonego pudełka jest dotarcie do zielonej płytki na platformie. Wykorzystując pewne mechanizmy na platformie, gracz powinien umieścić zielone pudełko na zielonej płytce. Wszystkie poziomy w grze mają unikalne kody dostępu, których możesz użyć, aby później przejść bezpośrednio do danego poziomu.